（岩石）かんらん岩
（鉱物）砂白金
（化石）アンモナイト
（岩石）錦石（主に玉髄からなる岩石）
（鉱物）菱マンガン鉱
（化石）アオモリムカシクジラウオ
（岩石）蛇紋岩
（鉱物）鉄鉱石
（化石）シルル紀サンゴ化石群
（岩石）スレート
（鉱物）砂金
（化石）ウタツギョリュウ
（岩石）硬質泥岩
（鉱物）黒鉱
（化石）ナウマンヤマモモ
（岩石）デイサイト凝灰岩
（鉱物）ソロバン玉石（カルセドニー）
（化石）ヤマガタダイカイギュウ
（岩石）片麻岩
（鉱物）ベグマタイト鉱物
（化石）フタバスズキリュウ
（岩石）花崗岩
（鉱物）リチア電気石
（化石）ステゴロフォドン
（岩石）大谷石（凝灰岩）
（鉱物）黄銅鉱
（化石）木の葉石（植物化石）
（岩石）鬼押出し溶岩（安山岩）
（鉱物）鶏冠石
（化石）ヤベオオツノジカ
（岩石）片岩
（鉱物）スチルプノメレン
（化石）パレドパラドキシア
（岩石）房州石（凝灰質砂岩・細礫岩）
（鉱物）千葉石
（化石）木下貝層の貝化石群
（岩石）無人岩
（鉱物）単斜エンスタタイト
（化石）トウキョウホタテ
（岩石）トーナル岩
（鉱物）湯河原沸石
（化石）丹沢層群のサンゴ化石群
（岩石）翡翠輝石岩
（鉱物）自然金
（化石）石炭紀-ペルム紀海生動物化石群
（岩石）オニックスマーブル（トラバーチン）
（鉱物）十字石
（化石）八尾層群の中新世貝化石群
（岩石）珪藻土（珪藻泥岩）
（鉱物）霰石
（化石）大桑層の前期更新世化石群
（岩石）笏谷石（火山礫凝灰岩）
（鉱物）自形自然砒
（化石）フクイラプトル キタダニエンシス
（岩石）玄武岩溶岩
（鉱物）日本式双晶水晶
（化石）富士川層郡の後期中新世貝化石群
（岩石）黒曜石
（鉱物）ざくろ石
（化石）ナウマンゾウ
（岩石）チャート
（鉱物）ヘデン輝石
（化石）ペルム紀化石群
（岩石）赤岩（凝灰角礫岩）
（鉱物）自然テルル
（化石）掛川層郡（大日層）の貝化石群
（岩石）松脂岩
（鉱物）カオリン
（化石）師崎層郡の中期中新世海生化石群
（岩石）熊野酸性岩類
（鉱物）辰砂
（化石）ミエゾウ
（岩石）湖東流紋岩
（鉱物）トパーズ
（化石）古琵琶湖湖層群の足跡化石
（岩石）鳴滝砥石（前期三畳紀珪質粘土岩）
（鉱物）桜石（菫青石仮晶）
（化石）綴喜層群の中新世貝化石群
（岩石）和泉石[和泉青石]（砂岩）
（鉱物）ドーソン石
（化石）マチカネワニ
（岩石）アルカリ玄武岩
（鉱物）黄銅鉱
（化石）丹波竜（タンバティタニスアミキティアエ）
（岩石）玄武岩枕状溶岩
（鉱物）ざくろ石
（化石）前期更新世動物化石
（岩石）珪長質火成岩類
（鉱物）サニディン
（化石）白亜紀動物化石群
（岩石）砂丘堆積物
（鉱物）クロム鉄鉱
（化石）中新世魚類化石群
（岩石）君待石（凝灰質砂岩）
（鉱物）自然銀
（化石）ミズホタコブネ
（岩石）万成石（花崗岩）
（鉱物）ウラン鉱
（化石）成羽植物化石群
（岩石）広島花崗岩
（鉱物）蝋石
（化石）アツガキ
（岩石）石灰岩
（鉱物）銅鉱石
（化石）美祢層群の植物化石
（岩石）青色片岩
（鉱物）紅れん石
（化石）プテロトリゴニア
（岩石）讃岐石（古銅輝石安山岩）
（鉱物）珪線石
（化石）コダイアマモ
（岩石）エクロジャイト
（鉱物）輝安鉱
（化石）イノセラムス
（岩石）花崗岩類（閃長岩）
（鉱物）ストロナルシ石
（化石）シルル紀動物化石群
（岩石）石炭
（鉱物）リチア雲母
（化石）脇野魚類化石群
（岩石）陶石（変質流紋岩火砕岩）
（鉱物）緑柱石
（化石）唐津炭田の古第三紀化石群
（岩石）デイサイト溶岩
（鉱物）日本式双晶水晶
（化石）茂木植物化石群
（岩石）溶結凝灰岩
（鉱物）鱗珪石（トリディマイト）
（化石）白亜紀恐竜化石群
（岩石）黒曜石
（鉱物）斧石
（化石）更新世淡水魚化石群
（岩石）鬼の洗濯岩（砂岩泥岩互層）
（鉱物）ダンブリ石
（化石）シルル紀-デボン紀化石群
（岩石）シラス（主に入戸火砕流堆積物）
（鉱物）金鉱石（自然金）
（化石）白亜紀動物化石群
（岩石）琉球石灰岩
（鉱物）リン鉱石
（化石）港川人